De acuerdo con la estructura orgánica de la Uptc, las Facultades Seccionales se supedita a la Sede Central. No obstante, el incremento de la población estudiantil que ingresó a los Programas regionales hizo ineludible la necesidad de una mayor autonomía, ante lo cual la Universidad procedió a efectuar una reforma en su estructura orgánica. El Acuerdo No. 008 de enero de 1987, sentó las bases para la descentralización, elevó las Seccionales a la categoría de Facultades e Se instauró el Consejo de Facultad, como máximo órgano directivo en cada una de ellas.
La Uptc Sede Duitama, se crea mediante la Resolución 343 del 10 de septiembre de 1971. Surge con base en el proyecto de poner en funcionamiento las Licenciaturas en Educación Industrial, Mecánica y Electricidad, programas que posteriormente fueron aprobados e inaugurados el 19 de septiembre de 1975, por el Ministerio de Educación Nacional mediante las Resoluciones 4588 y 4746 de 1975.
En 1972, se abre la jornada diurna para estos Programas, lo que permite visualizar el crecimiento de la Seccional. Así, se logra una alianza estratégica con el municipio de Duitama, en calidad de Comodato, se adquiere un terreno donde hoy funciona la Uptc Sede Duitama.
En 1979, se realiza un estudio que analiza la economía regional en sus diversos sectores. Se seleccionan varias iniciativas hasta llegar a definir el sector agrícola como altamente prioritario para el desarrollo del departamento de Boyacá. Así, con la participación de entidades públicas, el Centro Interamericano de Agricultura Tropical y empresarios privados, se comienza a ofrecer Administración Agrícola en el primer semestre de 1980.
A finales de los setenta, un grupo de profesionales realiza el estudio para la creación del Programa de Administración Industrial, con el fin de brindar una nueva oferta educativa a la comunidad boyacense y nacional. En 1980, el Programa inicia actividades en el segundo semestre.
Mientras tanto, en 1979, una Comisión de Expertos sustenta, ante los organismos competentes, una Propuesta para la creación de Ingeniería Electromecánica. Se trata de cumplir un doble objetivo: el de solucionar los requerimientos regionales, y el de marcar el derrotero tecnológico del sector productivo. Se crea, con el cumplimiento de la reglamentación para tal objeto. En el mismo año, gracias a un trabajo mancomunado con la Sede Central, se funda el Programa de Licenciatura en Matemáticas y Estadística.
Por su parte, en el año 1980, la Facultad de Ciencias Económicas y Administrativas de Tunja, realiza un estudio, en el cual reconoce la actividad turística como elemento económico dinamizador del Departamento y del país, lo que propicia la creación del programa Administración Turística y Hotelera.
Por último, la Uptc, continuando con su proceso de expansión, realiza un estudio basado en el desarrollo del importante corredor industrial de Boyacá, para contribuir con la competitividad, productividad e innovación del sector industrial boyacense, crea el programa de Diseño Industrial, en el año 1994.
Posteriormente, el Acuerdo No. 067 del 25 de octubre de 2005, por el cual se expide la Estructura Académica de la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, se asume la reorganización orgánica en SEDES SECCIONALES, considerando la consolidación de la Facultad Sede Seccional Duitama.
Según Acuerdo 001 de 2018 de la Uptc, que modifica el Acuerdo No. 063 de 2016, que determina la Estructura Orgánica, para la Uptc, donde se considera a la Seccional Duitama, como una Facultad adscrita a la Vicerrectoría Académica de la Uptc, con su Consejo de Facultad, integrado conforme a lo dispuesto en el Acuerdo No. 067 de 2005, con funciones señaladas.
Teniendo en cuenta el Acuerdo 108 de 1999, modificado por el Acuerdo 28 de 2002 y el Acuerdo 025 de 2012, por los cuales, se definen, organizan y reglamentan los estudios de Posgrado, se crean os Programas de Especializaciones y Maestrías en la Sede Duitama.
Hoy, la Sede Duitama de la Uptc, con más de cuatro décadas de existencia académica en el sistema de educación superior colombiana, se consolida como el más relevante Centro Educativo Universitario de las provincias del Tundama y del Norte de Boyacá.
